Амидаза (AMD)
Ферменттер:Макромолекулярдык биологиялык катализаторлор болуп саналат, көпчүлүк ферменттер белоктор
Амидаза:Ацил тобун сууга өткөрүп, эркин кислоталарды жана аммиакты өндүрүү менен ар кандай эндогендик жана бөтөн алифаттык жана ароматтык амиддердин гидролизин катализдейт. Гидроксам кислоталары жана башка органикалык кислоталар өсүү факторлорунун, антибиотиктердин жана шишик ингибиторлорунун курамдык бөлүгү болгондуктан, дары катары кеңири колдонулат. Амидазаларды катализатордун стереоселективдүүлүгүнө жараша R тибиндеги жана S тибиндеги ацилазаларга бөлүүгө болот.
Амиддердин гидролизин катализдөөдөн тышкары, амидаза гидроксиламин сыяктуу кошумча субстраттардын катышуусунда ацил алмашуу реакцияларын да катализдей алат.
Ар кандай булактардан алынган амидазалар ар кандай субстраттык өзгөчөлүккө ээ, алардын айрымдары ароматтык амиддерди гана гидролиздей алат, айрымдары алифаттык амиддерди гана гидролиздей алат, ал эми кээ бирлери α-же ω-аминоамиддерди гидролиздейт. Көпчүлүк аминдер ациклдик же жөнөкөй ароматтык амиддер үчүн гана жакшы каталитикалык активдүүлүккө ээ, бирок татаал ароматтар үчүн гетероциклдик амиддер, айрыкча орто алмаштыруучулары бар амиддер, жалпысынан төмөн активдүүлүккө ээ (бир нече гана ферменттер жакшы каталитикалык эффекттерди көрсөтөт).
Каталитикалык механизм:
| Ферменттер | Продукт коду | Продукт коду |
| Фермент порошогу | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | 19 амидаза топтому, ар бири 50 мг, 19 даана * 50 мг / даана, же башка санда |
| Скрининг комплекти (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 амидаза топтому, ар бири 1 мг, 19 даана * 1 мг / даана |
★ Субстраттын жогорку өзгөчөлүгү.
★ Хиралдык селективдүүлүктүн күчтүүлүгү.
★ Жогорку конвертациялоо натыйжалуулугу.
★ Азыраак кошумча продукциялар.
★ Жеңил реакция шарттары.
★ Айлана-чөйрөгө зыян келтирбейт.
➢ Субстраттын өзгөчөлүгүнөн улам белгилүү бир субстраттар үчүн ферменттик скрининг жүргүзүлүшү керек жана максаттуу субстратты эң жакшы каталитикалык эффект менен катализдеген ферментти алуу керек.
➢ Жогорку температура, жогорку/төмөн рН жана жогорку концентрациядагы органикалык эриткич сыяктуу экстремалдык шарттар менен эч качан байланышпаңыз.
➢ Адатта, реакция системасына субстрат, буфердик эритме (ферменттин оптималдуу реакциясынын рН мааниси) кириши керек. Ацил алмашуу реакция системасында гидроксиламин сыяктуу кошумча субстраттар болушу керек.
➢ AMD оптималдуу рН жана температурадагы реакция системасына акыркы болуп кошулушу керек.
➢ Бардык AMD түрлөрү ар кандай оптималдуу реакция шарттарына ээ, ошондуктан алардын ар бирин өз-өзүнчө изилдөө керек.
1-мисал(1):
Ар кандай амид субстраттарына гидролиз активдүүлүгү
| Субстрат | Белгилүү бир иш-аракет мкмоль мин-1mg-1 | Субстрат | Белгилүү бир иш-аракет мкмоль мин-1mg-1 |
| Ацетамид | 3.8 | ο-OH бензамид | 1.4 |
| Пропионамид | 3.9 | p-OH бензамид | 1.2 |
| Лактамид | 12.8 | ο-NH2бензамид | 1.0 |
| Бутирамид | 11.9 | p-NH2бензамид | 0,8 |
| Изобутирамид | 26.2 | ο-Толуамид | 0.3 |
| Пентанамид | 22.0 | p-Толуамид | 8.1 |
| Гексанамид | 6.4 | Никотинамид | 1.7 |
| Циклогексанамид | 19.5 | Изоникотинамид | 1.8 |
| Акриламид | 10.2 | Пиколинамид | 2.1 |
| Метакриламид | 3.5 | 3-Фенилпропионамид | 7.6 |
| Пролинамид | 3.4 | Индол-3-ацетамид | 1.9 |
| Бензамид | 6.8 |
Реакция рН 7,5 болгон 50 мМ натрий фосфатынын буфердик эритмесинде 70 ℃ температурада жүргүзүлдү.
| Амиддер | Гидроксиламин | Гидразин |
| Ацетамид | 8.4 | 1.4 |
| Пропионамид | 18.4 | 3.0 |
| Изобутирамид | 25.0 | 22.7 |
| Бензамид | 9.2 | 6.1 |
Реакция рН 7,5 болгон 50 мМ натрий фосфатынын буфердик эритмесинде 70 ℃ температурада жүргүзүлдү.
Байланыштуу реагенттин концентрациясы: амиддер, 100 мМ (бензамид, 10 мМ); гидроксиламин жана гидразин, 400 мМ; фермент 0,9 мкМ.
2-мисал(2):
3-мисал(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al. Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Го ФМ, Ву ЖП, Ян ЛР ж.б. Процесс биохимиясы, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Чжэн Р.К., Джин Дж.К., Ву З.М. жана башкалар. Биоорганикалык химия, 2017, Интернетте жеткиликтүү 7.
