Амидаза (AMD)
Ферменттер:Макромолекулярдык биологиялык катализаторлор, көпчүлүк ферменттер белоктор
Амидаза:Эркин кислоталарды жана аммиакты өндүрүү менен ацил тобун сууга өткөрүп берүү аркылуу ар кандай эндогендик жана чет өлкөлүк алифаттык жана ароматтык амиддердин гидролизин катализдөө.Гидроксамдык кислоталар жана башка органикалык кислоталар дары катары кеңири колдонулат, анткени алар өсүү факторлорунун, антибиотиктердин жана шишик ингибиторлорунун курамына кирет.Амидазаларды катализатордун стереоселективдүүлүгү боюнча R жана S тибиндеги ацилазаларга бөлүүгө болот.
Амидаза амиддердин гидролизин катализдөөдөн тышкары, гидроксиламин сыяктуу ко-субстраттардын катышуусунда ацилди өткөрүү реакцияларын да катализдей алат.
Ар түрдүү булактары бар амидаза ар кандай субстрат спецификасына ээ, алардын айрымдары ароматтык амиддерди гана гидролиздей алат, кээ бирлери алифаттык амиддерди, кээ бирлери α- же ω-амиддерди гидролиздей алат.Аминдердин көбү ациклдүү же жөнөкөй ароматтык амиддер үчүн гана жакшы каталитикалык активдүүлүккө ээ, бирок татаал ароматтыктар үчүн гетероциклдүү амиддер, өзгөчө орто алмаштыруучулары бар амиддер, негизинен, активдүүлүгү төмөн (бир нече гана ферменттер жакшы каталитикалык эффект көрсөтөт).
Каталитикалык механизми:
Ферменттер | Продукт коду | Продукт коду |
Enzyme Powder | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | 19 амидазалардын топтому, ар бири 50 мг 19 пункт * 50 мг / пункт же башка санда |
Скрининг комплекти (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 амидазалар топтому, 1 мг ар бир 19 пункт * 1 мг / пункт |
★ Жогорку субстрат өзгөчөлүгү.
★ Күчтүү хиралдык тандоо.
★ Жогорку конверсия натыйжалуулугу.
★ Азыраак кошумча продуктылар.
★ Жеңил реакция шарттары.
★ Экологиялык жактан таза.
➢ Ферменттердин скрининги субстраттын өзгөчөлүгүнөн улам конкреттүү субстраттар үчүн жүргүзүлүшү керек жана эң жакшы каталитикалык эффект менен максаттуу субстратты катализдөөчү ферментти алуу керек.
➢ Эч качан экстремалдык шарттар менен байланышпаңыз: жогорку температура, жогорку/төмөн рН жана жогорку концентрациядагы органикалык эриткич.
➢ Адатта, реакция системасы субстрат, буфердик эритмени камтышы керек (ферменттин оптималдуу реакция рН).Гидроксиламин сыяктуу ко-субстраттар ацил өткөрүү реакциясынын системасында болушу керек.
➢ AMD оптималдуу реакция рН жана температурасы менен реакция системасына акыркы жолу кошулушу керек.
➢ AMDдин бардык түрлөрүнүн ар кандай оптималдуу реакция шарттары бар, ошондуктан алардын ар бири жекече изилдөө керек.
Мисал 1(1):
Ар кандай амиддик субстраттарга гидролиздик активдүүлүк
Субстрат | Өзгөчө активдүүлүк мкмоль мин-1mg-1 | Субстрат | Өзгөчө активдүүлүк мкмоль мин-1mg-1 |
Ацетамид | 3.8 | ο- OH бензамид | 1.4 |
Пропионамид | 3.9 | p- OH бензамид | 1.2 |
Лактамид | 12.8 | ο-NH2бензамид | 1.0 |
Бутирамид | 11.9 | p-NH2бензамид | 0.8 |
Изобутирамид | 26.2 | ο-Толуамид | 0.3 |
Пентанамид | 22.0 | p-Толуамид | 8.1 |
Гексанамид | 6.4 | Никотинамид | 1.7 |
Циклогексанамид | 19.5 | Изоникотинамид | 1.8 |
Акриламид | 10.2 | Пиколинамид | 2.1 |
Метакриламид | 3.5 | 3-фенилпропионамид | 7.6 |
Пролинамид | 3.4 | Индол-3-ацетамид | 1.9 |
Бензамид | 6.8 |
Реакция 50 мМ натрий фосфат буфердик эритмесинде, pH 7,5, 70 ℃ температурада жүргүзүлгөн.
Амидтер | Гидроксиламин | Гидразин |
Ацетамид | 8.4 | 1.4 |
Пропионамид | 18.4 | 3.0 |
Изобутирамид | 25.0 | 22.7 |
Бензамид | 9.2 | 6.1 |
Реакция 50 мМ натрий фосфат буфердик эритмесинде, pH 7,5, 70 ℃ температурада жүргүзүлгөн.
Тиешелүү реагент концентрациясы: амидтер, 100 мМ(бензамид, 10 мМ);гидроксиламин жана гидразин, 400 мМ;фермент 0,9 мкм.
Мисал 2(2):
Мисал 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al.Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, et al.Процесс биохимиясы, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, et al.Биоорганикалык химия, 2017, Интернетте жеткиликтүү 7.